Nova tehnika razkriva, kako virus Zika deluje v naših celicah

Anonim

Znanstveniki so razvili novo tehniko, ki lahko določi, kako virusi komunicirajo z lastno RNA gostitelja. Ta tehnika, ki jo danes objavljamo v metodah narave, lahko raziskovalcem omogoči oblikovanje umetnih molekul, ki bi lahko blokirale proces replikacije virusov in preprečile širjenje virusa, poleg tega pa bi zagotovili vpogled v to, kako virus usmerja gostiteljsko celico za ustvarjanje novih virusnih delcev.

RNA virusi pogosto menijo, da predstavljajo največjo grožnjo za sprožitev svetovne pandemije. Če ni učinkovitih in razpoložljivih cepiv ali zdravil, bolezni, ki jih povzročajo virusi RNK, kot so virus Ebola, virus Zika in SARS, koronavirus, pomembno vplivajo na javno zdravje, medtem ko virusi, ki napadajo prašiče, povzročajo velike škode industriji prašičereja. Medtem se novi virusi RNA še naprej pojavljajo zaradi njihovega hitrega razvoja.

RNA virusi so tako imenovani, ker uporabljajo RNA namesto DNK, da predstavljajo svojo genetsko kodo. Njihov genom kodira proteine ​​in interagira s stroji gostiteljske celice. Vendar pa je bila doslej struktura virusnih RNA genov med notranjostjo gostiteljske celice večinoma neznana.

Znanstveniki na Univerzi v Cambridgeu so razvili novo tehniko za določitev strukture in interakcij genoma Zika virusa znotraj človeških celic. Tehnika se imenuje COMRADES (križna povezava ujemajočih se RNA in DEep Sequencing) in, kar je pomembno, se lahko uporablja za katerikoli RNA virus v katerikoli gostiteljski celici. Podrobne informacije, pridobljene od COMRADES, ponujajo možnost, da oblikujejo novo generacijo zdravil, ki delujejo tako, da blokirajo interakcije z RNA virusom gostitelja ali motijo ​​bistvene strukture v virusnem genomu.

Naše lastne celice vsebujejo tudi RNA, ne glede na to, ali gre za kodiranje beljakovin "messenger RNAs" ali "nekodirane RNA", ki urejajo različne vidike celične funkcije. Cikel okužbe virusov RNK poteka predvsem v celični citoplazmi, kjer živijo številne RNA. Molekule virusa in gostiteljice RNA lahko neposredno vplivajo na "bazno parjenje" vzdolž delov svoje strukture - z drugimi besedami, naredimo vrsto vezi, da skupaj zmešamo obe molekuli. Te interakcije ponujajo potencialne tarče za protivirusna terapija in pravzaprav protivirusno zdravilo proti virusu hepatitisa C, ki cilja na tako interakcijo RNA interakcije med gostiteljem in virusom, Miraversen, trenutno v naprednih kliničnih preskušanjih.

Vendar pa je razširjenost naravnega nastajajočega bazičnega parjenja gostiteljskih virusov RNA neznana, odkritja novih interakcij pa so redki. Nova romska tehnika COMRADES, ki jo je razvil dr. Omer Ziv na Wellcome Trust / Cancer Research UK Gurdon Institute z mednarodno ekipo kolegov, lahko preveri bazno sezono gostiteljskih virusov in odkrije interakcijske sekvence RNA v enem poskusu.

Dr. Ziv in njegovi sodelavci so uporabili metodo COMRADES za raziskovanje genomov virusa Zika v človeških celicah, ki razkrivajo njegovo strukturo in večkratne interakcije z človeškimi regulatornimi nekodirajočimi RNA-ji, kot so mikro RNA, prenosi RNA in majhne jedrske RNA. Z novo tehniko se razkrije identiteto in položaj vsakega baznega para, ki zagotavlja potrebne in zadostne informacije za oblikovanje komplementarnih sekvenc, ki bi lahko vplivale in blokirale vsako interakcijo s potencialnimi kliničnimi učinki. Metoda COMRADES zato odpira vrata za oblikovanje nove generacije protivirusnih zdravil, ki temeljijo na RNA, za različne vrste virusov RNA v kateri koli gostiteljski celici.

Dr. Ziv, postdoc v laboratoriju profesorice Eric Miske na Inštitutu Gurdon, je dejal: "S tehniko COMRADES lahko raziščemo podrobne molekularne interakcije med virusom in gostiteljsko RNA, kar bi nam omogočilo oblikovanje kratkih RNA ali DNA sekvenc, ki jih je mogoče ki se uporabljajo za motnje v teh interakcijah, ki potencialno preprečujejo sposobnost virusa, da posnema in okužijo nadaljnje celice. Informacije, ki jih dobimo od COMRADES, odprejo vrata popolnoma novemu načinu za reševanje teh virusov. Glede na široko uporabnost te tehnike za vsak virus RNK in vsaka gostiteljska celica, tako ljudske kot živalske RNA virusne bolezni so lahko cilj takih raziskav. "

menu
menu