Dve nepovezani študiji povzročata odkritje inhibitorjev CRISPR-Cas12a

Znanstvena misel: Jan Kralj & Anton Donchev (Junij 2019).

Anonim

Dve ekipi, ki delata neodvisno drug od drugega, sta določila več inhibitorjev CRISPR-Cas12a. Prvo ekipo so sestavljali člani iz Univerze v Kaliforniji, Berkeley, drugi pa člani Splošne bolnišnice Massachusetts in Kalifornijske univerze. Oba sta uporabila orodja za bioinformatiko za pregled bakterijskih genomov za morebitne zaviralce in obe objavili rezultate v reviji Science.

CRISPR je tehnika za urejanje genov, ki lahko identificira segmente DNA in jih odreza iz genomov. Uporablja se lahko tudi za zamenjavo segmentov, ki so bili izrezani. CRISPR za opravljanje svojih nalog uporablja beljakovinsko nukleazo, ki služi kot vodilo ali predlogo, pri čemer navede, kateri geni se bodo rezali in / ali zamenjali. Cas9, ki se je pogosto uporabljal v ta namen v številnih zgodnjih študijah, je bil povezan s tehniko. Toda za Cas9, da deluje pravilno, so raziskovalci morali dodati tudi zaviralec Cas9 - njegova naloga je bila preprečiti tuje rezanje. V zadnjem času so raziskovalci uporabili Cas12a, saj ponujajo druge želene značilnosti, ki jih ni mogoče najti v Cas9. Toda doslej ni bilo nobenih znanih inhibitorjev za Cas12a, ki so pri raziskovalnih prizadevanjih preprečili njegovo uporabo. V teh dveh novih prizadevanjih sta obe ekipi našli več inhibitorjev, za katere trdijo, da so primerni za uporabo s programom CRISPR.

Obe ekipi sta uporabili pristop bioinformatičnega cevovoda pri iskanju inhibitorjev Cas12 - to je sistem za iskanje bakterijskih genomov, ki vključuje iskanje genskih fragmentov, ki so običajno smrtni za bakterije, vendar niso usmerjeni proti bakterijam, ki imajo inhibitorje. Z uporabo tega pristopa je prva skupina našla tri zaviralce, med njimi tudi tiste, ki so imenovale AcrVA1. Preskušanje s človeškimi celicami je pokazalo, da se lahko vsa tri zdravila uporabljajo z CRISPR. Z uporabo istega osnovnega pristopa je druga ekipa našla več kandidatov, ki so prav tako delali, kot so se upali pri testiranju s človeškimi celicami. Druga ekipa je tudi ugotovila, da je AcrVA1 še posebej učinkovit.

Skupaj je delo obeh skupin prineslo več možnih inhibitorjev Cas12a, od katerih je eden očitno še posebej obetaven. To bi lahko privedlo do bolj plodnih raziskav z uporabo CRISPR-Cas12a kot novega orodja za urejanje genov.

menu
menu